MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Listeria monocytogenes Clip81459

Total Repeats: 8454

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012488	AC	3	6	36	41	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_012488	T	6	6	221	226	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012488	TACAT	2	10	291	300	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_012488	A	6	6	301	306	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012488	G	7	7	307	313	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012488	CTATTA	2	12	1787	1798	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_012488	T	6	6	1805	1810	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012488	ATTA	3	12	1811	1822	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012488	A	7	7	1849	1855	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012488	T	7	7	3055	3061	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012488	A	7	7	4475	4481	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012488	T	8	8	4504	4511	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012488	AATA	2	8	4512	4519	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012488	C	6	6	4524	4529	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
15	NC_012488	A	7	7	4542	4548	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012488	AT	3	6	4561	4566	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012488	TAT	2	6	4581	4586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012488	A	7	7	4620	4626	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012488	TGA	2	6	5999	6004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012488	AAAG	2	8	6006	6013	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012488	AAT	2	6	6022	6027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012488	TAA	2	6	7986	7991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012488	TTA	2	6	7997	8002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012488	T	6	6	10643	10648	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012488	A	7	7	12822	12828	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012488	TAA	2	6	12835	12840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012488	A	6	6	12851	12856	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012488	AT	3	6	15879	15884	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012488	AAC	2	6	15896	15901	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_012488	GTT	2	6	15914	15919	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012488	TAT	2	6	15977	15982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012488	T	6	6	15984	15989	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012488	ATT	2	6	15996	16001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012488	CCA	2	6	16051	16056	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_012488	ATA	2	6	16060	16065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012488	ATA	2	6	16076	16081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012488	ATA	2	6	16093	16098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012488	TAT	2	6	16122	16127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012488	ATC	2	6	16841	16846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_012488	TCA	2	6	16857	16862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_012488	TTG	2	6	16874	16879	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012488	AAT	2	6	16882	16887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012488	ATT	2	6	16895	16900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012488	T	7	7	16908	16914	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012488	A	6	6	16938	16943	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012488	AACC	2	8	17012	17019	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_012488	TAT	2	6	17028	17033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012488	ATA	2	6	17047	17052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012488	TTG	2	6	17061	17066	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_012488	ATT	2	6	17081	17086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012488	AATT	2	8	17122	17129	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012488	ATA	2	6	17296	17301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012488	CCAA	2	8	17506	17513	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_012488	CT	3	6	17566	17571	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_012488	T	7	7	17587	17593	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012488	AAG	2	6	17598	17603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012488	AAT	2	6	17640	17645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012488	ATTGT	2	10	17720	17729	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012488	GTT	2	6	17735	17740	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_012488	CAT	2	6	17797	17802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_012488	ATC	2	6	17819	17824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_012488	TAT	2	6	17878	17883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012488	ATT	2	6	17926	17931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012488	T	6	6	17930	17935	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012488	A	6	6	17942	17947	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012488	T	6	6	17992	17997	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_012488	AT	3	6	18056	18061	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012488	A	6	6	18145	18150	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012488	T	7	7	18160	18166	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_012488	T	6	6	18190	18195	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012488	CTT	2	6	18220	18225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_012488	G	6	6	19410	19415	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
73	NC_012488	CTC	2	6	23512	23517	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_012488	T	8	8	23580	23587	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012488	A	6	6	23642	23647	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_012488	ATT	2	6	23654	23659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012488	GAG	2	6	23716	23721	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_012488	TCA	2	6	25186	25191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_012488	AAATG	2	10	26104	26113	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012488	TTA	2	6	26153	26158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_012488	A	6	6	26201	26206	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_012488	CG	3	6	26245	26250	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_012488	AAG	2	6	27925	27930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_012488	GGA	2	6	29560	29565	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_012488	ATT	2	6	30303	30308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_012488	T	6	6	30316	30321	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_012488	GGA	2	6	30322	30327	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_012488	AAAT	2	8	30984	30991	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_012488	A	8	8	30999	31006	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_012488	AT	3	6	31031	31036	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_012488	TCA	2	6	31042	31047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_012488	A	6	6	31148	31153	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_012488	AGGA	2	8	31162	31169	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_012488	GTC	2	6	31171	31176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_012488	TAA	2	6	33092	33097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_012488	T	8	8	35402	35409	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_012488	TCC	2	6	35437	35442	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_012488	T	6	6	36184	36189	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_012488	TA	3	6	36328	36333	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_012488	CAAT	2	8	36349	36356	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_012488	AGT	2	6	36411	36416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_012488	AT	3	6	36423	36428	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_012488	GAAAA	2	10	36435	36444	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_012488	TAAA	2	8	36453	36460	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_012488	AAG	2	6	36475	36480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_012488	A	8	8	36482	36489	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_012488	TTA	2	6	36522	36527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_012488	T	7	7	36636	36642	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_012488	CAA	2	6	36655	36660	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_012488	T	7	7	36668	36674	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_012488	TAG	2	6	36680	36685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_012488	AGATA	2	10	36691	36700	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_012488	TTGA	2	8	36729	36736	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_012488	TG	3	6	36813	36818	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_012488	A	6	6	36823	36828	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_012488	A	7	7	36832	36838	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_012488	A	6	6	36850	36855	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_012488	AGA	2	6	36858	36863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_012488	AAAGG	2	10	37662	37671	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
120	NC_012488	CTATT	2	10	38158	38167	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_012488	T	6	6	38220	38225	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_012488	T	6	6	38320	38325	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_012488	A	6	6	38358	38363	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_012488	A	7	7	38718	38724	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_012488	T	7	7	38743	38749	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_012488	CCTT	2	8	39566	39573	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_012488	ATA	2	6	40727	40732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_012488	CAA	2	6	40786	40791	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_012488	TCT	2	6	46701	46706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_012488	A	7	7	46771	46777	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_012488	ATG	2	6	46811	46816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_012488	AAAT	2	8	46864	46871	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_012488	AGG	2	6	47926	47931	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_012488	AGA	2	6	47932	47937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_012488	C	6	6	47957	47962	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
136	NC_012488	AGG	2	6	51492	51497	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_012488	ATAA	2	8	53426	53433	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_012488	GACTT	2	10	53455	53464	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
139	NC_012488	A	7	7	53489	53495	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_012488	AGTG	2	8	53504	53511	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_012488	T	7	7	54185	54191	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_012488	TC	3	6	54205	54210	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_012488	TTAG	2	8	54237	54244	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_012488	GTTA	2	8	55602	55609	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_012488	ATA	2	6	55620	55625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_012488	ATT	2	6	55647	55652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_012488	GCTC	2	8	55657	55664	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
148	NC_012488	ATGGT	2	10	55707	55716	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
149	NC_012488	AGG	2	6	55749	55754	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
150	NC_012488	ATTC	2	8	56061	56068	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
151	NC_012488	GAG	2	6	56097	56102	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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